三原山（東山）は、多重式の古死火山で、山の周囲には深い渓谷と尾根が刻まれており、北側は特に峻険な起伏になっている。山項部は東と西の肩の張った台地で、両端は海に急に降っており、北は大賀郷、三根のある平地で急崖となって降り、南側は複雑な地勢ではあるが緩い傾斜をもっている。山項の台地の峰は、中央に最高の三原山（700m）がそびえ、東の方へ西白雲山（630m）に続いて、東白雲出（607m）が隆起し、それより山の東の肩にある登龍峠の小連峰となって海に急下している。南は東台子由（637m）が少し離れて吃立し、それより数個の峰が続いて島の南端に達している。頂上の噴火口は、隆起した部分の間にある低地の大池（三原池）があり、それに近く小池がある。ともに降水が少なく渚水のないときには、池底を歩くことがでさる程度のものであるが、小池の緑には樹林が保護されているので、池面に乗り出た風情を添える老幹や砕積した谷などがあって山頂の池らしい観がある。